武汉病毒的基因报告(一)

作者:malfoy

武汉市卫生委员会(WHO)于2019年12月30日首次报告了中国湖北省武汉市浓缩性肺炎病例。疾病预防控制中心(CDC)和中国卫生当局后来确定并宣布,一种新的冠状病毒(CoV)引起了武汉市的肺炎爆发。来自多个群体的科学家从住院病人身上获得了病毒样本。在电镜下观察到分离的病毒形态相同。

武汉冠状病毒的一个基因组序列(WH-Human_1)于2020年1月10日发布,随后又发布了五个额外的武汉冠状病毒基因组序列。目前的突发公共卫生事件在一定程度上与2003年中国爆发的SARS疫情类似。

在当前爆发的公共卫生事件中,当务之急便是了解武汉冠状病毒的来源和原寄主,并评估这种新型冠状病毒在跨物种或人与人之间传播的公共健康风险。为了解决这些与武汉爆发的病原体有关的重要问题,我们首先将武汉冠状病毒的基因组序列与已知感染人类的基因组序列进行了比较,即SARS冠状病毒和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS)冠状病毒。再将两种病毒基因组相对比发现,作为武汉冠状病毒代表的WH-human_1基因组与SARS-CoV的基因组具有更好的同源性。

为了了解武汉冠状病毒的起源及其与其他冠状病毒的亲缘关系,专家对来自不同来源的冠状病毒序列进行了系统发育分析。结果表明,武汉冠状病毒属于betacornavirus属。Betacoronavirus是一种被包裹的单链RNA病毒,可感染野生动物、畜群和人类,导致偶尔暴发,更常见的是无明显症状的感染。根据武汉冠状病毒独特的系统发育位置,它们很可能与SARS/SARS样冠状病毒(一种类似蝙蝠冠状病毒HKU9-1的共同祖先)共有。此类病毒在它们的进化过程中存在频繁的基因重组事件,这可以从它们的基因组之间的高同源序列的片段中得到证明。

总的来说,武汉冠状病毒与人类感染SARS冠状病毒之间有相当大的遗传距离,与MERS冠状病毒的遗传距离更大。这一观察结果提出了一个重要的可能,即武汉冠状病毒采用了与SARS冠状病毒或MERSCoV用于跨物种/人类传播相同的机制,或涉及一种新的、不同的传播机制。

(文章内容仅代表作者观点)

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